射频识别门禁和生物识别门禁最大的区别就是认证的介质和方式不同，射频识别门禁是以ID卡、IC智能卡为介质，认证介质容易丢失，损坏，ID卡也比较容易复制。生物识别门禁目前有指纹、掌形、面像、虹膜等识别方式，认证介质不会丢失，安全性更好。射频识别门禁和生物识别门禁在不同的要求和应用场合均得到了广泛的采用。不过，生物认证模式由于技术发展的瓶颈，在稳定性、应用成本和系统构建难度等方面还存在一定的问题和实际应用的难度。当然，随着技术的不断发展，这些难题有些已经破解。为了提高系统安全性和适用性，智能卡多重认证、智能卡+密码认证和生物识别+智能卡认证等复合认证模式得到了发展。
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